Utilisateurs autorisés, Bureaucrates, Ingénieurs ISIG, Utilisateurs autorisés automatiquement, Masqueurs de modifications
375
modifications
« Accès à une BDD PostgreSQL » : différence entre les versions
Aller à la navigation
Aller à la recherche
m
aucun résumé des modifications
mAucun résumé des modifications |
mAucun résumé des modifications |
||
| Ligne 58 : | Ligne 58 : | ||
</syntaxhighlight>ou pour une table comprenant des géométries:<syntaxhighlight lang="r"> | </syntaxhighlight>ou pour une table comprenant des géométries:<syntaxhighlight lang="r"> | ||
sf::st_read(dsn=conn,layer="StudyArea_reach_zone") | sf::st_read(dsn=conn,layer="StudyArea_reach_zone") | ||
</syntaxhighlight>Pour des tables plus volumineuses, il peut être pertinent de réaliser un filtre (en SQL) avant de récupérer la | </syntaxhighlight>Pour des tables plus volumineuses, il peut être pertinent de réaliser un filtre (en SQL) avant de récupérer la donnée (voir section suivante). | ||
=== Quelques fonctions utiles en R pour interagir avec la BDD glourb === | |||
Pour une table sans géométries<syntaxhighlight lang="r"> | Pour interagir avec la BDD glourb depuis R, quelques fonctions utiles sont disponibles dans le package glourbi, installable via la commande suivante: | ||
<syntaxhighlight lang="r"> | |||
devtools::install_github("lvaudor/glourbi") | |||
</syntaxhighlight> | |||
Les identifiants uniques de villes dans la BDD glourb sont sous forme de citycode (par exemple "596477_20972" pour Lyon). | |||
On peut passer du nom de ville au citycode et inversement par les fonctions suivantes: | |||
<syntaxhighlight lang="r"> | |||
glourbi::to_citycode("Lyon") # renverra "596477_20972" | |||
glourbi::to_cityname("596477_20972") # renverra "Lyon" | |||
</syntaxhighlight> | |||
La fonction glourbi::connect_to_glourb() permet de créer une connexion à la base de données. On peut l'appeler de cette façon (une fois que les paramètres d'accès à la BDD sont enregistrés dans .Renviron) | |||
<syntaxhighlight lang="r"> | |||
conn=glourbi::connect_to_glourb() | |||
</syntaxhighlight> | |||
Les fonctions suivante (du package glourbi, disponible ici :https://github.com/lvaudor/glourbi ) permettent de filtrer les lignes relatives à une ville donnée dans une table(on lui fournit un citycode en entrée). | |||
Pour une table sans géométries | |||
<syntaxhighlight lang="r"> | |||
get_city_tib <- function (name, thisCityCode, conn) | get_city_tib <- function (name, thisCityCode, conn) | ||
{ | { | ||
| Ligne 78 : | Ligne 104 : | ||
return(result) | return(result) | ||
} | } | ||
</syntaxhighlight> | |||
On peut donc s'en servir de la manière suivante: | |||
<syntaxhighlight lang="r"> | |||
conn=connect_to_glourb() | |||
gsw_patches_Denver=get_city_sf(name="gsw_patches", | |||
thisCityCode=glourbi::to_citycode("Denver-Aurora"), | |||
conn=conn) | |||
txt_page_Douala=get_city_tib(name="txt_page", | |||
thisCityCode=glourbi::to_citycode("Douala"), | |||
conn=conn) | |||
</syntaxhighlight> | </syntaxhighlight> | ||
[[Catégorie:Tutoriel]] | [[Catégorie:Tutoriel]] | ||
[[Catégorie:Outils]] | [[Catégorie:Outils]] | ||
[[Catégorie:Données]] | [[Catégorie:Données]] | ||