« R: construire un package » : différence entre les versions

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mAucun résumé des modifications
mAucun résumé des modifications
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- Pour '''soi''' (réunir un certain nombre de fonctions, et les documenter pour un usage futur)
- Pour '''soi''' (réunir un certain nombre de fonctions, et les documenter pour un usage futur)


- Pour **les autres** (réunir un certain nombre de fonctions, les documenter et faciliter l'installation de ces fonctions par d'autres utilisateurs notamment via une *installation* plutôt que par des copier-collers de code.
- Pour '''les autres''' (réunir un certain nombre de fonctions, les documenter et faciliter l'installation de ces fonctions par d'autres utilisateurs notamment via une *installation* plutôt que par des copier-collers de code.


== Pourquoi construire un package? ==
== Pourquoi construire un package? ==


- Pour **réunir un certain nombre de fonctions** s'intégrant dans une **problématique commune**
- Pour '''réunir un certain nombre de fonctions''' s'intégrant dans une '''problématique commune'''
- Pour rendre son travail **plus facilement reproductible** que par un partage de script simple
- Pour rendre son travail '''plus facilement reproductible''' que par un partage de script simple
- Pour **partager** et **valoriser** ses codes
- Pour '''partager''' et '''valoriser''' ses codes




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Dans le menu principal de RStudio, faire:
Dans le menu principal de RStudio, faire:


File => New Project => New Directory => R package
''File => New Project => New Directory => R package''


Le dossier est automatiquement construit et contient:
Le dossier est automatiquement construit et contient:


- **.Rproj**: le fichier indiquant à R les caractéristiques du projet
- '''.Rproj''': le fichier indiquant à R les caractéristiques du projet
-📋 **DESCRIPTION** : le fichier de description du package (auteur, description de l'objectif du package, licence, etc.), à compléter / modifier  
-📋 '''DESCRIPTION''' : le fichier de description du package (auteur, description de l'objectif du package, licence, etc.), à compléter / modifier  
-📋 **NAMESPACE**: le fichier (read-only) qui **liste les fonctions du package**, celles qui sont exportées (donc utilisables directement par les futurs utilisateurs du package) et les autres (celles qui servent au(x) développeur(s) uniquement)
-📋 '''NAMESPACE''': le fichier (read-only) qui '''liste les fonctions du package''', celles qui sont exportées (donc utilisables directement par les futurs utilisateurs du package) et les autres (celles qui servent au(x) développeur(s) uniquement)
-📁 **R**: contient l'ensemble des scripts correspondant aux codes des fonctions
-📁 '''R''': contient l'ensemble des scripts correspondant aux codes des fonctions
-📁 **man**: (pour "manual") contient l'ensemble des fichiers d'aide i.e. la documentation associée à chaque fonction
-📁 '''man''': (pour "manual") contient l'ensemble des fichiers d'aide i.e. la documentation associée à chaque fonction

Version du 6 avril 2022 à 08:56

Cette page reprend quelques idées de base pour faciliter la construction d'un package sous R.

Pour qui construire un package?

- Pour soi (réunir un certain nombre de fonctions, et les documenter pour un usage futur)

- Pour les autres (réunir un certain nombre de fonctions, les documenter et faciliter l'installation de ces fonctions par d'autres utilisateurs notamment via une *installation* plutôt que par des copier-collers de code.

Pourquoi construire un package?

- Pour réunir un certain nombre de fonctions s'intégrant dans une problématique commune - Pour rendre son travail plus facilement reproductible que par un partage de script simple - Pour partager et valoriser ses codes


Création de l'arborescence des fichiers

Dans le menu principal de RStudio, faire:

File => New Project => New Directory => R package

Le dossier est automatiquement construit et contient:

- .Rproj: le fichier indiquant à R les caractéristiques du projet -📋 DESCRIPTION : le fichier de description du package (auteur, description de l'objectif du package, licence, etc.), à compléter / modifier -📋 NAMESPACE: le fichier (read-only) qui liste les fonctions du package, celles qui sont exportées (donc utilisables directement par les futurs utilisateurs du package) et les autres (celles qui servent au(x) développeur(s) uniquement) -📁 R: contient l'ensemble des scripts correspondant aux codes des fonctions -📁 man: (pour "manual") contient l'ensemble des fichiers d'aide i.e. la documentation associée à chaque fonction